Une base de preuves structurée
Le 27 juillet 2026, Scientific Data a publié PPIKB, une ressource sur les interactions peptide-protéine développée par des chercheurs de l'Université polytechnique de Macao et de l'Université de science et technologie de Macao. L'équipe a extrait manuellement l'information d'articles évalués par des pairs, de brevets publics et d'entrées de la Protein Data Bank, plutôt que de s'appuyer sur une source expérimentale unique.
Son module quantitatif contient 21 845 mesures de liaison portant sur 2 151 cibles protéiques. Le module structural comprend 18 005 complexes protéine-peptide résolus expérimentalement. Les entrées incluent la séquence du peptide et les informations sur ses modifications, les mesures de liaison lorsqu'elles existent, les métadonnées du dosage et des liens entre enregistrements structuraux et enregistrements de mesures.
Comparer les mesures de liaison et les structures
Les auteurs présentent PPIKB comme une ressource pour la recherche d'information, l'évaluation comparative, les recherches de similarité et l'entraînement de modèles. Elle peut donc être utile lorsqu'une question de recherche demande un ensemble de départ traçable de données peptide-protéine ou un moyen de comparer des enregistrements de dosages et des structures.
Une base de données ne valide pas à elle seule un nouveau candidat. La signification d'un résultat de liaison dépend toujours du dosage, de la séquence et des modifications du peptide, de la construction de la cible et du contexte expérimental. Il vaut donc mieux lire cette ressource comme une infrastructure de recherche, et non comme un prédicteur de performance clinique.