La semaine écoulée a apporté trois nouvelles études sur les peptides qui méritent un examen attentif. Deux d'entre elles s'attaquent à l'un des plus grands problèmes de la médecine actuelle : les bactéries qui ne répondent plus à nos antibiotiques. La troisième porte sur un peptide osseux bien connu et cherche à savoir s'il peut être rendu plus durable dans l'organisme.
Une version du tériparatide à action plus prolongée
Le 16 octobre, une équipe de l'Université du Shandong et de l'Académie des sciences pharmaceutiques du Shandong a publié des travaux sur le tériparatide dans le Journal of Medicinal Chemistry. Le tériparatide est constitué des 34 premiers acides aminés de l'hormone parathyroïdienne, mais il se dégrade rapidement une fois dans l'organisme.
Les chercheurs ont examiné le peptide position par position pour repérer les endroits où il pouvait être modifié sans risque, puis ont fixé des chaînes d'acides gras sur des sites de sérine et de thréonine. Sur les 12 nouvelles versions obtenues, quatre ont conservé une activité proche de l'original. L'une d'elles, le composé 62, a beaucoup mieux résisté dans le sérum sanguin.
Il s'agit de travaux précliniques précoces, mais ils montrent comment de petites modifications chimiques peuvent rendre un peptide beaucoup plus stable.
L'apprentissage profond conçoit de nouveaux lipopeptides antimicrobiens
Le 17 octobre, des chercheurs de l'Université Jiao-tong de Shanghai ont rapporté dans Nature Communications avoir utilisé un modèle d'apprentissage profond pour concevoir des lipopeptides, de courts peptides dotés d'une queue d'acide gras.
Ils sont partis de séquences peptidiques tirées de 96 911 génomes bactériens et ont réduit des milliers de candidats à 289. Ils en ont ensuite fabriqué 46 en laboratoire, dont 44 ont montré une activité antimicrobienne, soit un taux de réussite de près de 96 %. C'est exceptionnellement élevé pour ce type de recherche.
Leur composé principal, LP630, a agi contre un large éventail de bactéries et donné de solides résultats chez des souris porteuses de plaies infectées. Ces travaux n'ont pas encore été testés chez l'humain.
Un peptide dérivé de grenouille contre un germe hospitalier résistant
Le 19 octobre, un groupe dirigé depuis le Houston Methodist Hospital a publié dans Frontiers in Microbiology une étude sur CIT8, un peptide de 13 acides aminés. Il s'agit d'une version raccourcie, optimisée par apprentissage automatique, de la citropine 1.1, un peptide naturel présent chez une rainette australienne.
Ils ont testé CIT8 contre Acinetobacter baumannii, un germe hospitalier qui résiste souvent aux antibiotiques carbapénèmes et figure sur la liste de priorité critique de l'Organisation mondiale de la santé. CIT8 a bloqué 15 souches sur 16 à 4 µg/mL, y compris des souches résistantes. À 20 µg/mL, il a ramené les bactéries vivantes à des niveaux indétectables en 15 minutes, et il a aussi renforcé l'action de l'antibiotique méropénème contre les souches résistantes.
Jusqu'à présent, CIT8 n'a été testé qu'en laboratoire, et les auteurs présentent la poursuite des essais précliniques comme l'étape suivante.
Ce que tout cela représente
Ensemble, ces études montrent la rapidité d'évolution de la science des peptides, où la conception informatique, les composés naturels et une chimie minutieuse ouvrent de nouvelles options. Aucun de ces travaux n'a encore atteint le stade des essais chez l'humain, et le chemin reste donc long. Nous continuerons de suivre chaque étude à mesure qu'elle progresse.