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肽的发现数据资源

澳门团队发布大型肽与蛋白质相互作用资源

PPIKB 汇集了实测的肽结合数据和经实验解析的蛋白质与肽结构,用于肽的发现与建模。

一个结构化的证据库

2026 年 7 月 27 日,《Scientific Data》发表了 PPIKB,这是由澳门理工大学和澳门科技大学研究人员开发的肽与蛋白质相互作用资源。团队从同行评审论文、公开专利和 Protein Data Bank 记录中手工提取信息,而不是依赖单一的实验来源。

其定量模块包含 2,151 个蛋白质靶点上的 21,845 项结合测量。结构模块包含 18,005 个经实验解析的蛋白质与肽复合物。条目包括肽序列和修饰信息、可得时的结合测量、实验元数据,以及结构记录与测量记录之间的关联。

比较结合测量和结构

作者把 PPIKB 描述为一个用于查询、基准比较、相似性搜索和模型训练的资源。因此,当某个研究问题需要一组可追溯的肽与蛋白质证据作为起点,或需要一种比较实验记录和结构的方法时,它可能有用。

数据库本身并不能验证新的候选物。结合结果的意义仍取决于实验方法、肽的序列和修饰、靶点构建以及实验背景。因此,最好把这一资源理解为研究的基础设施,而不是临床表现的预测工具。

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