Lipidowany peptyd pierścieniowy zablokował fuzję SARS-CoV-2 w nowy sposób. Peptyd o nazwie S-880008 przedstawił zespół z firmy Shionogi i Uniwersytetu Hokkaido, kierowany przez Sanakiego, Kawaguchiego, Anraku i współpracowników, w Nature Communications 28 października 2026 roku.
Dotychczasowe prace mają charakter strukturalny i zwierzęcy. Peptydu nie testowano na ludziach.
Czym jest S-880008
S-880008 to peptyd makrocykliczny, czyli taki, którego aminokwasy są połączone w pierścień, z dołączonym łańcuchem lipidowym. Zespół znalazł go metodą mRNA display, laboratoryjną techniką przeszukiwania bardzo dużych bibliotek peptydów pod kątem tych, które wiążą wybrany cel.
Podwójny chwyt kolca
Badacze ustalili następnie za pomocą krioEM, jak peptyd chwyta kolec wirusa. Trzyma go w dwóch miejscach naraz. Pierścień osadza się tam, gdzie domena wiążąca receptor (RBD) styka się z poddomeną 1, a łańcuch lipidowy wsuwa się w domenę N-końcową sąsiedniego protomeru, jednej z trzech jednostek kolca.
Ten podwójny chwyt blokuje kolec w kształcie, w którym wszystkie trzy RBD są uniesione, zwanym RBD 3-up. Zapobiega też rozchodzeniu się protomerów, a to blokuje fuzję, czyli etap, w którym wirus zlewa się z komórką gospodarza.
Różne warianty i myszy
Peptyd działał wobec różnych wariantów SARS-CoV-2, w tym Omikron. Podany do nosa zakażonym myszom, obniżył miano wirusa i poprawił przeżywalność.
Jak wczesny jest to etap
To wyniki badań na zwierzętach i strukturalne. Czy peptyd byłby bezpieczny i skuteczny u ludzi oraz jak by go podawano, to pytania dla dalszych badań.