Липидированный кольцевой пептид блокировал слияние SARS-CoV-2 новым способом. Пептид S-880008 описала группа Shionogi и Университета Хоккайдо под руководством Санаки, Кавагути, Анраку и коллег в Nature Communications 28 октября 2026 года.
Пока работа структурная и на животных. На людях она ещё не проверялась.
Что такое S-880008
S-880008 это макроциклический пептид, то есть его аминокислоты соединены в кольцо, с присоединённой липидной цепью. Группа нашла его с помощью мРНК-дисплея, лабораторного метода скрининга огромных библиотек пептидов в поисках тех, что связываются с выбранной мишенью.
Двойная фиксация на шиповидном белке
Затем исследователи с помощью крио-ЭМ выяснили, как пептид прикрепляется к шиповидному белку вируса. Он удерживает шип сразу в двух точках. Кольцо располагается там, где рецептор-связывающий домен (RBD) встречается с субдоменом 1, а липидная цепь входит в N-концевой домен соседнего протомера, одной из трёх единиц шипа.
Эта двойная фиксация закрепляет шип в форме с тремя поднятыми RBD, называемой RBD 3-up. Она также не даёт протомерам разойтись, а это блокирует слияние, то есть этап, на котором вирус сливается с клеткой хозяина.
На разных вариантах и у мышей
Пептид действовал на разные варианты SARS-CoV-2, включая омикрон. При введении в нос инфицированным мышам он снижал вирусную нагрузку и улучшал выживаемость.
Насколько ранняя эта стадия
Это структурные результаты и данные на животных. Будет ли пептид безопасным и эффективным у людей и как его вводить, покажут будущие исследования.